MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori ELS37 plasmid pHPELS37

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017064	AAC	2	6	14	19	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017064	T	6	6	40	45	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017064	CAA	2	6	102	107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_017064	AAAG	3	12	121	132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017064	TAG	2	6	198	203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017064	CAA	2	6	214	219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017064	T	6	6	315	320	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017064	AG	3	6	348	353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017064	TGA	2	6	383	388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017064	GCAT	2	8	407	414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_017064	C	6	6	423	428	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12	NC_017064	TG	3	6	538	543	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017064	AAC	2	6	589	594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017064	A	7	7	717	723	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017064	A	6	6	730	735	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017064	AAACA	2	10	781	790	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_017064	AGG	2	6	801	806	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017064	TCA	2	6	858	863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017064	A	6	6	863	868	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017064	CAGA	2	8	869	876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_017064	TAG	2	6	920	925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017064	A	6	6	942	947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017064	AATC	2	8	997	1004	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_017064	CAA	2	6	1008	1013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017064	T	6	6	1038	1043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017064	ACAA	2	8	1049	1056	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_017064	TTG	2	6	1116	1121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017064	TTAAA	2	10	1142	1151	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017064	TTAG	2	8	1313	1320	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017064	GGT	2	6	1343	1348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017064	ATA	2	6	3974	3979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017064	TTA	2	6	4023	4028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017064	ACT	2	6	4079	4084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017064	CCT	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_017064	TTA	2	6	4218	4223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017064	TAA	2	6	4241	4246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017064	AAG	2	6	4263	4268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017064	AAG	2	6	4285	4290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017064	AAG	2	6	4307	4312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017064	AAG	2	6	4329	4334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017064	AAG	2	6	4351	4356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017064	CG	4	8	4438	4445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_017064	A	6	6	4464	4469	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017064	TAA	2	6	4491	4496	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017064	AAC	2	6	4498	4503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_017064	AGTTTT	2	12	4529	4540	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017064	CGCTT	2	10	4662	4671	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.